关于年休假补偿，病假工资，离职法定补偿金的问题

我在一家广州的公司工作，现在合同到期单位提出不续签。在3年合同期内我没有休过年假，现向公司讨要3倍经济补偿，公司不给。在合同到期前我请了病假，有医院病假证明。现在公司不赔偿年休假，说“自己没有申请休就没了”，也没有支付病假工资。
公司是广州注册公司，劳动合同约定工作地点在上海，上海有个小办公室但上海并没有注册。我实际是在南京在家办公，社保也交在南京。请问我该在上海申请仲裁，还是在南京仲裁。如果仲裁我要求3年年休假和病假工资，我能赢吗？
感觉公司好像很有把握仲裁能赢，最后甩给我的是“反正我们不赔，你想怎么样就怎么样），我该怎么办呢？
问过南京的仲裁，回答“年休假不受理，江苏有规定，要劳动监察处理”，但劳动监察说“外地企业，我们没办法”。
后咨询朋友，说应该到上海仲裁，因为我的劳动合同约定的'工作地点是上海。但实际上，我除了出差，都是在南京的。另，到目前我还没有办理离职手续，公司崔办，说一周内不办，就“视作放弃了法定补偿金”，3个月工资，就这么没了？目前我还在请病假（病已经好了），如仲裁我赢不了，我也不用给医生讲好话，开证明了。